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Informática Biomédica (herramienta para la medicina)

Introduccióna la Informática Biomédica (IB)

 

“Cualquier médico que pueda ser reemplazado por una computadora, merece serlo.”
Warmner V. Slack

 

En la actualidad la tecnología tiene una gran influencia estando presente en nuestras labores del día a día. Las tecnologías de información y comunicación (TIC) se han vuelto parte imprescindible para algunas personas, facilitando trabajos, manteniendo comunicación a distancia, etc.

No existe una definición concreta para contestar a la pregunta “¿Qué es la Informática Biomédica?”, sin embargo se puede realizar una definición integradora tomando en cuenta diferentes categorías:

  • Orientada a la tecnología de la información: conocida también como “computación clínica” o “computación en medicina”, hace énfasis en las computadoras y las tecnologías.
  • Basada en roles, tareas o dominios: se centra en la informática dentro de las organizaciones (informática en enfermería, informática de salud pública…)
  • Orientada a conceptos: se dirigen a conceptos específicos como; Datos, Información, Conocimiento y Sabiduría (DICS).

A pesar de las diferentes definiciones, tomaremos en cuenta la que da la organización más importante en el mundo que agrupa a los expertos en esta 

  • AMIA (American Medical Informatics Association): “Informática biomédica es el campo científico interdisciplinario que estudia y persigue el uso efectivo de datos, información y conocimientos biomédicos, para la indagación científica, la solución de problemas y la toma de decisiones, motivada por los esfuerzos para mejorar la salud humana.”

Esta definición es la más aceptada, además de que combina las categorías de rol, tarea o dominio con las orientadas a conceptos, haciendo más completa la descripción.

 Existen 4 corolarios agregados a la anterior descripción

 1.    Desarrolla, estudia y aplica teorías…

2.    Aporta y potencia las ciencias y tecnologías…

3.    Construye puentes entre la investigación básico clínica y la práctica en los sistemas de atención en salud…

4.    Los usuarios son seres humanos, por ende toma en cuenta recursos como las ciencias sociales y de la conducta.

La IB tiene una relación directa con diversas categorías en la medicina, por ejemplo se conoce como “bioinformática” a todo lo relacionado con procesos celulares y moleculares, “informática clínica” es específica para individuos (pacientes), “informática en salud” tiene relación con las poblaciones y la sociedad, por ejemplo la epidemiología.

Existen temas con un poco de mayor complejidad, por ejemplo las imágenes biomoleculares tienen su función dentro de dos grandes grupos la “bioinformática” y la “informática de imagenología”, y la farmacogenómica entra en los grupos de “informática clínica” y “bioinformática”.

Estos límites indefinidos se suponen por las varias disciplinas señaladas, dándole la característica adaptativa y dinámica a la IB.


Complemento

 Si el tema te interesó, te recomiendo leer el siguiente artículo:

Artículo “A Fundamental Theorem of Biomedical Informatics”

(Resumen de artículo)

El propósito del artículo es aclarar lo que es la Informática Biomédica y lo que no es, con esto podremos entender que una persona que trabaja con recursos de información es mejor en comparación que una persona que no lo hace. Este teorema es aplicable en diversas situaciones, incluida la medicina y la atención a la salud.

 El teorema fundamental de la Informática Biomédica es representado por el Dr. Miller, quien expone que hay mejores resultados cuando una persona trabaja con recursos de información, y según Reed Gardner la informática es solo el 20 % de la tecnología, así que esta no se debe encasillar solamente en computadoras y celulares.

Tenemos que recordar lo que la Informática Biomédica NO es un reemplazo del ser humano, sino una herramienta que proporcione adecuadas soluciones a las necesidades del ocupante.

A novice's quest for knowledge in Health Informatics

People nowadays are always eager to learn about new and up coming technologies and gadgets, myself included. Filipinos have come to be tech-savvy individuals, that being “online” has become a part of everyday life. When curiousity strikes we simply go online, search and find related articles that feed our hunger for answers, some unfortunately can do us more harm than good.

Our health sectors has moved beyond jotting down patient data and demographics on to utilizing computers to store and retrieve information. Various institutions both government and private are now making the shift towards electronic health records. Paving way for the future of health care innovation in our country are like minded individuals who want to utilize their knowledge of medicine and information technology.

As a novice in the field of Medical Informatics, I’d like to learn more about how data through context can be turned to information. How information with semantics can become knowledge and perhaps serve as a world model though ontology. Information and knowledge can vary from each application, a patient may use it for self treatment and support, clinical staff shall employ it to come up with diagnosis and treatment, management on the other hand wields it to raise funds, manage and allocate resources. Being able to appreciate the growth and progress of Health Informatics in our country will help me see the competencies our countrymen have. Making use of available albeit limited resources to move forward and proove excellence to the world.

Only Direct Way of Therapeutic Effects

For the procedure turn cavitation apparatus and by working maniples processes the fat zone. Its area is 25 square centimeters.   The volume of the extracted fat from the body in one session of cavitation is approximately equal to 15 cubic centimeters. It should be noted that fat tissue has a low density, but has a large amount, so the patient feels the first decrease in volume. After completion of the procedures recommended maintaining a healthy lifestyle, proper nutrition and water treatments.

For the duration of the procedure of ultrasonic cavitation should not exceed 60 minutes. Sessions are allowed to spend no more than once in ten days. The full course consists of 3-4 sessions. If you need a specialist beautician can in six months to appoint a second supporting course consisting of one to three treatments.

The procedure is carried out in conjunction with cavitation that can accelerate the process of withdrawal of broken fat cells through the lymphatic system and drainage.  Cavitation is the only direct way of therapeutic effects on fat cells, can rightly be called non-surgical liposuction and abdominoplasty. After years of stagnation in cosmetology and aesthetic medicine in medical informatics degree has finally appeared safe and effective means of solving the problems of excess weight and cellulite.

The duration of treatment of ultrasonic cavitation, in conjunction with lymphatic drainage and pressure therapy is equal to 60-90 minutes. Produced by the effect becomes noticeable after the first session, and the subsequent conduct only intensified.

Modelo DICS. Taxonomía de la información y el conocimiento.

Dentro del área de informática en salud, hay algo conocidocomo “jerarquía de la información”, “pirámide del conocimiento ” o “modeloconceptual DICS”, este modelo es integrado por los conceptos de datos, información, conocimiento y sabiduría (en inglés DIKW; data, information, knowledge and wisdom).

Los datos, son antecedentes necesarios para llegar al conocimiento exacto de algo o para deducir las consecuencias de un hecho, dentro del contexto médico un dato es definido como cualquier observación relacionada con un paciente o una población. Un dato es un signo o síntoma, se obtiene mediante la observación (una mirada nerviosa), recolección (signos vitales, historia clínica) y análisis (resultados de laboratorio y gabinete).

Los datos se dividen en:

  • Datos narrativos: se obtiene de manera verbal durante la historia clínica del paciente, estos son registrados en los expedientes clínicos.
  • Datos numéricos: son los valores de los estudios de laboratorio y los signos vitales.
  • Señales registradas: son datos registrados de manera continua mediante herramientas tecnológicas como del electrocardiograma, densitometría, etc.
  • Imágenes: como las imágenes radiológicas.

La información son los datos con significado, la interpretación y entendimiento de los datos es necesario durante un diagnóstico, para lograr interpretar los datos se debe de considerar el contexto en el que se reciben y se utilizan, ya que estas interpretaciones llegan a ser subjetivas y lo que puede ser información valiosa para alguien, para otra persona no lo es. El concepto de información, responde a preguntas como ¿qué?, ¿quién?, ¿cuándo? y ¿dónde?

El conocimiento es la forma de aplicación, es un concepto más complejo y existe menos consenso en cuanto a su definición pero podríamos atribuir el conocimiento a la experiencia y la capacidad cognitiva de cada individuo, el resultado final es la transformación de la información a la aplicación. El conocimiento nos ayuda a responder el ¿cómo?, un concepto importante de este es que se divide en el conocimiento explícito (se encuentra en libros, artículos, etc.) es como el saber qué para obtener un resultado, y por otra parte existe el conocimiento tácito (el que proviene de la experiencia), este se refiere al saber cómo hacer las cosas en base a la experiencia personal.

Por último la sabiduría es el último nivel de la pirámide, y se requiere de los tres conceptos anteriores para poder llegar a ella, esta se vincula con la intuición, la comprensión y la interpretación, abarcando un nivel superior de abstracción que el conocimiento, con esta se intenta ver más allá del horizonte e intentar predecir el futuro de un diagnostico al ser aplicado.

La sabiduría es subjetiva, se basa en el juicio ético, la experiencia y las creencias personales de cada individuo, requiere de una mente humana abierta y dispuesta a enfrentar retos. Es por esto que el médico necesita ser experimentado y reflexivo, para poder obtener un diagnóstico, que con base en su experiencia acumulada le ofrezca al enfermo la mejor opción.

El modelo DICS, es el utilizado actualmente por los profesionales de la informática en salud, sin embargo existen desventajas en su uso, como que el modelo es lineal y positivista, y la realidad difiere en cuanto a lo lineal del modelo, aún falta demostración empírica formal que valide el modelo de manera inequívoca.

Para más información relacionada con el modelo DICS, se recomienda consultar la siguiente bibliografía:

Ackoff, R.L. (1989). From data to wisdom. J Appl Syst Anal.

- Frické, M. (2009). The knowledge pyramid: a critique of the DIKW hierarchy. J Inform Sci.

- Van Bemmel, J.H. et al. (1988). Data, information and knowledge in medicine. Methods Inf Med.

More from the RSNA

Another fascinating day at the 97th annual meeting of the RSNA.

I attended a fun (for the inner geek in us all) lecture, “Cool Technologies for Radiologists” given by Drs. Richardson, Petscavage and Thapa, based on their ebook of a similar name (available on Amazon).

Besides all of the new diagnostic imaging equipment, there were several interesting new technologies for education and interacting with complex data sets.

Anatomage has a product call ‘The Table’ an interactive anatomy study table. This is a virtual cadaver, a touch screen the size of an actual dissection table that you can manipulat 3D CT data. Very cool!

We also demoed two new methods of interacting with volumetric data from CTs.

Digital ArtForms was demonstrating their iMedic3D, a two-handed interface for moving through 3D space, such as in virtual colonoscopy, as well as their iMedicPACS, which allows the user to navigate through multiplanar views of cross sectional imaging.

GestSure Technologies new product uses a Microsoft Kinect style interface designed so that surgeons can manipulate CT images in the sterile environment of the operating room.

These devices are still works in progress, but I look forward to the future development of these types of interfaces.

不整脈にヨガが効果、リスク半減しうつ軽減も=米研究
2011年 04月 4日 14:53 JST

 [ニューオーリンズ 2日 ロイター] 血圧やコレステロールを下げるとして広く知られているヨガが、不整脈のリスクを半減させることが分かった。米国心臓病学会(ACC)の年次会合で新たな研究結果が発表された。
 今回の研究は、高齢者に多く見られる不整脈の一種、心房細動に対するヨガの効果を初めて調べたもの。その結果、ヨガにより心房細動の件数が半減したほか、心房細動に関連する不安やうつの症状も軽減したことが明らかになった。
 研究を指揮したカンザス大学病院の准教授、Dhanunjaya Lakkireddy博士は「心房細動に対する現在の一般的な治療の多くが(体に負担の大きい)侵襲性治療や望まぬ副作用のある薬物治療であることから、(ヨガの効果が示されたことは)重要な発見だ」と述べた。
 博士はヨガのもたらす効果や低いコストを理由に、心房細動やほかの不整脈の治療の一環としてヨガを取り入れるべきとする一方、今回の研究結果を裏付けるには一段の調査が必要とし、患者は引き続きこれまでの治療を続けるべきと述べた。
 今回の研究では、身体的制約がなくヨガの経験もない不整脈患者49人を対象に行われ、病院の調査グループが不整脈の件数を半年後に測定した。患者は最初の3カ月間は自分の好きな運動を行い、後半3カ月はプロの指導の下で45分間のヨガプログラムに週3回参加し、自宅でのヨガも推奨された。
 不整脈の件数についてはモニターが実験を通して終始記録する一方、患者は不安やうつ、全体的な生活の質について短い調査に答えた。
 その結果、平均で不整脈の件数は半減し、不安やうつの症状も著しく軽減したという。
Alternative Payment Study

Even if physician practices are taking part in new value-based healthcare payment models, a recent study indicates that they nonetheless need help with successfully managing increased amounts of data and figuring out how to respond to the diversity of programs and quality metrics from different payers.  The joint report aimed to describe the effects that alternative healthcare payment models apart from fee-for-service payment have on physicians and their practices in the US.  These payment models include shared savings, episode-based and bundled payment, capitation, pay for performance and retainer-based practice.  The study also included accountable care organizations (ACOs) and medical homes which are two recently expanding practice and organizational models that frequently participate in one or more of these alternative payment models.  Researchers then performed case studies of 34 physician practices in six diverse geographic markets.  

According to the report, many physician practices have been responding to this by merging with other medical practices or hospitals in an effort to better support the investments necessary to succeed in new payment models, such as care managers and IT.  According to practices, the realignment of their operations to the goals of the new payment strategies can be challenging when the necessary data isn’t available, or when different payment models conflict with each other.  The report discovered that alternative payment models have a mostly positive impact on practice stability, as well as the overall financial impact.  No practices surveyed experienced financial hardship from using new payment models, and there was a general agreement among physicians that the transition to alternative payment models has encouraged the development of collaborative team-based care to prevent the progression of disease.  Some other benefits for patients include increased access to care and physicians through community-based care.  

Not only that, but most physician leaders seemed optimistic about alternative payment models, while physicians who weren’t in leadership roles expressed some hesitance, especially with certain new documentation requirements.  For example, physicians were supportive of new patients registries that list patients with certain health conditions as a way to improve care.  Nonetheless, they had concerns about documentation requirements where the link to better care wasn’t as clear.  Researchers concluded that the operational details of alternative payment models could either help or hinder practices’ efforts to improve their own prowess.  For instance, practices are investing significantly in information systems to analyze large amounts of data about practice patterns, but when crucial data such as quality performance feedback and drug prices are either missing or inaccurate, it’s difficult for physician practices to use data analysis to improve care and cut on spending.  

While physician practices have been making significant investments in data collection, payers should also consider investing in the capability of physician practices to manage the information.  These investments could work to enhance the effectiveness of new payment models and help medical practices make the best use of computerized health records and other healthcare IT.  Researchers also noticed that payers should look into ways to harmonize key components of alternative payment models, particularly when it comes to performance measures.  Typically, medical practices contract with numerous payers, each of whom may have different performance measures tied to payment rewards, meaning that medical practices need to cope with how to address hundreds of performance measures and then create a coherent response.  If this cacophony of requirements can be eased, and government regulations can be aligned with alternative payment models, then physician practice leaders can devote their attention to making meaningful changes to processes that benefit patient care.  

Researchers also learned that most medical practices have shielded individual physicians from direct exposure to the new financial incentives that payers have created.  Even though practices are paid more for improved performance, practices tend to use nonmonetary incentives to encourage physicians to change their decision-making, such as providing performance feedback, meant to appeal to physicians’ sense of professionalism.  The study further found that alternative payment models haven’t changed the core content of physicians’ clinical work.  Efforts to improve efficiency by delegating some tasks to non-physicians actually ended up increasing the intensity of physicians’ work, raising concerns about burnout.  

My Spell Check doesn't recognize "Health Informatics"

My Spell Check doesn’t recognize “Health Informatics”

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Originally posted on SPH Life - Student Blog:

My post title reflects microsoft word’s ignorance and also my own ignorance before I came to U of M.  At its most basic, health informatics studies, creates and utilizes technology to monitor, improve and communicate health information. This is a big undertaking and because of that, this field is rapidly expanding in knowledge and opportunities for…

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Medical Applications of Computers

Since health care delivery is a business, any hospital, health plan, or independent medical practice involves much the same software as any other large business. This includes accounts receivable and payable, payroll, and supplies inventory. Both general and customized industry software can be used for these specific functions.

The management of information related to medical care is sometimes called medical informatics. The type of information gathered relies on many factors including the type of institution, ranging from a small doctor’s office to a large clinic or a big hospital and the nature and capacity of the treatment provided.



For outpatients, the required information includes a general medical information for each patient, including records of medical tests and their results, prescriptions and their status, etc. For hospital patients, there are also admissions records, a large list of itemized charges, and records that must be maintained for public health or other governmental purposes. Hospitals increasingly utilize customized, integrated hospital information systems that incorporate billing, medical records, and pharmacy.

Additional record keeping arise from the mechanisms used to pay for health care. Each health payment system, whether government-run or a private health protection organization has extensive rules and procedures regarding the fact how each surgery, treatment, test, or medication can be submitted for payment. The software must be able to use recognized classifications systems such as the Diagnostic and Statistical manual of mental Disorders.

 鬱病(うつびょう)の症状を客観的に診断するための指標となりうる物質を、広島大大学院(広島市)などの共同研究グループが世界で初めて発見したと30日発表した。成果は米科学誌、プロスワン電子版に掲載された。鬱病はこれまで、医師が患者の症状をもとに主観的に診断する方法が主流だが、今回の発見では、血液を調べることで客観的な診断方法の開発に役立つと期待される。
 発見した研究グループの山脇成人(やまわきしげと)教授によると、鬱病の要因は世界で研究されているが、糖尿病診断での血糖値や高血圧診断での血圧値のような客観的な指標は発見されておらず、気持ちの落ち込みや意欲の低下などの症状から、医師が判断するしかなかったという。
 山脇教授らは脳内に多く存在するタンパク質である「脳由来神経栄養因子(BDNF)」をつくる遺伝子に着目。未治療の鬱病患者20人と、鬱病でない18人の血液を採取して解析したところ、この遺伝子の中で起きる「メチル化」と呼ばれる化学反応をみると、鬱病患者にだけ特有のパターンが見つかった。過度のストレスが異常なメチル化を引き起こした可能性があるとみられる。
 BDNFは神経細胞の成長に不可欠な栄養素の物質で、これまでも動物実験などで鬱病と深い関係があることを示す研究データはあったが、BDNFの血液中の濃度に関する研究では関連が証明されていなかった。今回の手法が実用化できれば、費用は1万5千円程度で、2日間で結果が出るという。
 山脇教授らは「さらにデータを集め、抗鬱薬の投与や病状の変化と、メチル化の程度の変化の関連性などを調べて、鬱病の客観的な診断方法を確立したい」としている。


8月31日(水)8時6分配信

Snippet: House Easily Approves Bill To Speed Vets' Care

Snippet: House Easily Approves Bill To Speed Vets’ Care

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The House has overwhelmingly approved legislation to allow patients facing long waits for care at Veterans Affairs facilities to get VA-paid treatment from local doctors. Tuesday’s 421-0 vote was Congress’ latest response to the outcry over backlogs and falsified data at the VA. The bill is similar to a broader measure that the Senate plans to debate soon.

(more…)

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 子どもを望む日本人夫婦がタイに渡り、受精卵の染色体を調べて、男女産み分けをするケースが増えている。朝日新聞の取材で、この1年間で少なくとも30組の夫婦が利用していたことが分かった。受精卵の診断は「命の選別につながる」として、日本では重い遺伝病などに限られており、倫理的な課題が多い。
 受精卵診断はもともと遺伝病の有無を調べるために行う。体外受精卵が4~8個の細胞に分裂した段階で、1~2個の細胞を取って、遺伝子や染色体の異常がないか調べて、子宮に戻す。遺伝病だけでなく、性別も判定できるため、男女の産み分けにも使える。
 タイでは近年、医療技術が向上し、海外の患者にも人気の医療先進国になりつつある。受精卵診断も約15の医療機関が実施している。朝日新聞が、日本人が多く行く2施設に取材したところ、2~3年前から日本人が増え、この1年で計約30組が男女産み分けで受精卵診断を受けたと回答した。診断には体外受精が必要なため、不妊でない夫婦でも体外受精をしている。不妊夫婦が卵子提供を受け、男女の産み分けをする例もあるという。

2011年9月25日3時1分

 乳がん患者の3人に1人は、最初に診断された時と再発後では、がんのタイプが変化していることがわかった。がん組織を調べる検査は通常、診断時にしか行われず、再発後に「効かない」治療を受けている患者が相当数いる可能性が出てきた。同様の変化は、他のがんでも起きる可能性があるという。
 スウェーデンのカロリンスカ研究所が26日、欧州集学的がん学会で発表した。
 乳がんには、女性ホルモン陽性でホルモン療法が効くタイプと、女性ホルモン陰性で抗がん剤のハーセプチンが効くタイプ、いずれも効かないタイプがある。

2011年9月27日10時34分

ビタミン剤長期摂取の女性、がんリスク上昇 「生活習慣影響も」
がんセンター発表
2011/8/25 11:36

 ビタミンサプリメントを過去に摂取した女性はがんになるリスクが高いとの調査結果を国立がん研究センターがまとめ、25日発表した。週に1日以上、1年間以上摂取した経験のある人は、まったく摂取したことがない人に比べてリスクが17%高かった。ただサプリメントの作用と発がんとの因果関係は明らかではないという。
 過去にサプリメントを摂取した経験を持つ女性は肥満や高血圧、糖尿病治療の割合も多かった。同センターの笹月静予防研究部室長はサプリメントが原因というよりも、「過去に摂取の経験がある人は不健康な傾向がある場合が多く、その影響も出たのではないか」とみている。
 調査は1990~2006年に40~69歳の男女約6万3千人を対象にアンケート方式で実施。期間中がんになった人は4501人。90年時点でサプリメントを摂取し、その後5年以内にやめた女性は摂取経験のない人に比べがんになる確率が17%高かった。
 男性ではこうした傾向は見られなかった。「(調査時点で)飲酒や喫煙をしている人の割合が高く、(それらに隠れて)サプリメントの影響が見えにくかった可能性が高い」としている。

関連キーワード
国立がん研究センター、ビタミンサプリメント、サプリメント

チョコレートが心臓病のリスク軽減につながる可能性=調査
ロイター 8月30日(火)11時34分配信

 [パリ 29日 ロイター] 欧州心臓病学会(ESC)で29日発表された新たな調査で、チョコレートの摂取により、心臓疾患の発症リスクが3分の1減少する可能性があることが分かった。ただ、チョコレートの食べすぎには気をつける必要があるとしている。
 特に血管系に良いとされる成分「フラバノール」を含むダークチョコレートなど、チョコレートの摂取による健康効果については近年複数の研究が発表されている。
 英ケンブリッジ大学のオスカー・フランコ氏とその調査チームは、チョコレートの摂取と心臓血管病に対するその健康効果との関連性を調べるため、計10万人を対象にこれまで実施された7件の研究結果を分析した。今回発表の調査は英医師会誌(BMJ)の電子版に掲載されている。
 それによると、7件中5件の研究でチョコレートの健康効果が示されたが、残り2件では示されなかった。総合的な結果では、チョコレートの消費水準が最も高い状態と最も低い状態を比べた場合、消費水準の高いほうが、心臓血管病のリスクが37%、心臓発作のリスクが29%低かったという。
 フランコ氏によると、7件の研究をまとめた今回の調査は完全なものではなく、ダークチョコレートとミルクチョコレートの区別をつけていないほか、健康効果がチョコレートの摂取だけによるものなのか、他の要素が関係しているのかを調べるには一段の調査が必要だという。
 フランコ氏は、チョコレートが心臓に良いようだということは分かったが、脂肪と糖分の多い「菓子」の持つ不健康さを考慮すると、健康効果は食べ過ぎによる悪影響で容易に打ち消される可能性があると警告。今回の調査に関与していない英国心臓財団(BHF)のビクトリア・テイラー氏も、「心臓疾患のリスクを減らしたいと思うならば、チョコレートを1箱買うよりも数段良い方法がある」と述べた。


最終更新:8月31日(水)16時23分

Venture Capitalist’s Provocation : ” Eighty percent of doctors could be replaced by machines.”

Venture capitalist, Vinod Khosla sparked a firestorm with his comments at the recent Health Innovation Summit:

Vinod Khosla says technology will replace 80 percent of doctors sparks indignation

Obviously Mr. Khosla is being intentionally provocative.


I think that what we practicing physicians should take away from this, is that perhaps 80% of what we do is better done with technology, leaving us to do the 20% that matters.


We don’t compound our own drugs, do our own Gram stains, or build our own x-ray machines. Let us use the machine to free us to do what no AI can do. Only a doctor, with our years of training and experience, has insight into the human condition and the understanding of the natural history of illness.


We physicians need to lead this transition, not be swept away by it.